Dia 1 – Segunda-feira – 6 de Agosto
08:00 - 09:00
Apresentação do Curso (Dr. Luiz Alcantara e Dr. Vasco Azevedo).
09:00 - 10:00
Introdução às técnicas de sequenciamento de Nova Geração - Teórica (Dr. Vasco Azevedo).
10:00 - 10:20
Coffee-Break.
10:20 - 12:20
Vigilância genômica e estudo da história evolutiva dos Flavivirus emergentes e re-emergentes - Teórica (Dr. Nuno Faria).
12:20 - 14:00
Almoço.
14:00 - 16:00
Organização e alinhamento dos genomas dos Flavivirus - Parte I Prática (Dr. Luiz Alcântara e Dra Marta Giovanetti).
16:00 - 16:20
Coffee-Break.
16:20 - 18:20
Organização e alinhamento dos genomas dos Flavivirus - Parte II Prática (Dr. Luiz Alcântara e Dra Marta Giovanetti).
Dia 2 – Terça-feira - 7 de agosto
8:00 - 10:00
Introdução à tecnologia de sequenciamento portátil da Oxford Nanopore "MinION" - Teórica (Dra. Marta Giovanetti e Dr. Rodrigo Dias).
10:00 - 10:20
Coffee-Break.
10:20 - 12:20
Montagem do genoma a partir de dados brutos do sequenciamento do MinION - Prática (Dra. Marta Giovanetti e Álvaro Salgado).
12:20 - 14:00
Almoço.
14:00 - 16:00
Preparo de biblioteca genômica para o sequenciamento via MinION - Teórica (Dr. Rodrigo Dias e Dra. Marta Giovanetti).
16:00 - 16:20
Coffee-Break.
15:00 - 17:00
Preparo de biblioteca genômica para o sequenciamento via MinION - Prática (Dr. Rodrigo Dias e Dra. Marta Giovanetti).
Dia 3 – Quarta-feira - 8 de agosto
8:00 - 10:00
Reconstrução Filogenética Parte I: Neighbor Joining e Maximum Likelihood - Teórica (Dra. Marta Giovanetti e Dr. Luiz Alcantara)
10:00 - 10:20
Coffee-Break.
10:20 - 12:20
Reconstrução Filogenética Parte II: Neighbor Joining e Maximum Likelihood - Prática (Dra. Marta Giovanetti e Dr. Tiago Graff)
12:20 - 14:00
Almoço.
14:00 - 16:00
Generalidades em arboviroses – com ênfase nos Flavivírus - Teórica (Dr. Adrián Diaz)
16:00 - 16:20
Coffee-Break.
16:20 - 18:20
Abordagens metodológicas para vigilância de arboviroses - Teórica. (Dr. Adrián Diaz)
Dia 4 – Quinta-feira - 9 de agosto
8:00 - 10:00
Teste de hipótese do relógio molecular Parte I - Teórica. (Dr. Tiago Graff)
10:00 - 10:20
Coffee-Break.
10:20 - 12:20
Teste de hipótese do relógio molecular Parte II - Prática. (Dr. Tiago Graff e Dra. Marta Giovanetti)
12:20 - 14:00
Almoço.
14:00 - 16:00
Diagnóstico das infecções por arbovírus Parte I - Teórica. (Dr. Adrián Diaz)
16:00 - 16:20
Coffee-Break.
16:20 - 18:20
Diagnóstico das infecções por arbovírus Parte II - Teórica/Prática. (Dr. Adrián Diaz)
Dia 5 – Sexta-feira - 10 de agosto
7:30 - 9:30
Filogeografia de flavivírus Parte I - Prática. (Dr.Tiago Graff e Dra. Marta Giovanetti)
9:30 - 9:50
Coffee-Break.
9:50 - 11:30
Filogeografia de flavivírus Parte II - Prática. (Dr.Tiago Graff e Dra. Marta Giovanetti)
11:30 - 13:00
Almoço.
13:00 - 14:00
Abordagens metagenômicas - Teórica. (Dr. Aristóteles Goes Neto e Dr. Gabriel Fernandes)
14:00 - 16:00
Designação taxonômica de OTUs no “QUIIME”- Parte I - Prática. (Dr. Aristóteles Goes Neto e Dr. Gabriel Fernandes)
16:00 - 16:20
Coffee-Break.
16:20 - 18:20
Designação taxonômica de OTUs no “QUIIME”- Parte II - Prática. (Dr. Aristóteles Goes Neto e Dr. Gabriel Fernandes)
Dia 6 – Segunda-feira - 13 de agosto
8:30 - 10:30
Metagenômica de shotgun - Prática. (Dr. Arthur Gruber)
10:30 - 10:50
Coffee-Break.
11:00 - 12:00
Metagenômica no MinION - Teórica. (Dra. Marta Giovanetti e Jaqueline Goes de Jesus)
12:20 - 14:00
Almoço.
14:00 - 15:00
Orientação de execução do projeto Parte I - Teórica. (Dra. Flavia Aburjaile e Dr. Rodrigo Dias)
15:00 - 17:00
Determinantes epidemiológicos e ecológicos da transmissão dos flavivírus - Teórica. (Dr. José Lourenço)
17:00
Coffee-Break.
Dia 7 – Terça-feira - 14 de agosto
8:00 - 10:00
Estudos metagenômicos e modelos probabilísticos aplicados para a descoberta de novos virus- Parte I Teórica (Dr. Arthur Gruber).
10:00 - 10:20
Coffee-Break.
10:20 - 12:20
Montagem progressiva para diagnóstico e descoberta de virus – Parte I - Prática Dr. Arthur Gruber).
12:20 - 14:00
Almoço.
14:00 - 16:00
Montagem progressiva para diagnóstico e descoberta de virus – Parte II - Prática Dr. Arthur Gruber).
16:00 - 16:20
Coffee-Break.
16:20 - 17:20
Orientação de execução do projeto Parte I - Teórica. (Dra. Flavia Aburjaile e Dr. Gabriel Fernandes)
17:20 - 18:20
Conferência: Desafios na pesquisa da dengue: uma perspectiva computacional - Teórica. (Dr. José Lourenço)
Dia 8 – Quarta-feira - 15 de agosto
8:00 - 10:00
Transcriptoma em infecções por vírus emergentes de países tropicais - Teórica (Dr. Gabriel Wallau e Dra. Flavia Aburjaile).
10:00 - 10:20
Coffee-Break.
10:20 - 12:20
Estudo de caso: Análise do transcriptoma de células infectadas por ZIKV - Prática (Dr. Gabriel Wallau, Dra. Flavia Aburjaile e Dr. Rodrigo Dias).
12:20 - 14:00
Almoço.
14:00 - 16:00
Tempo para realização do projeto, com acompanhamento dos professores - Prática.
16:00 - 16:20
Coffee-Break.
16:20 - 17:20
Tempo para realização do projeto, com acompanhamento dos professores - Prática.
Dia 9 – Quinta-feira - 16 de agosto
8:00 - 10:00
Análises de dados metagenômicos no “Rstudio” – Parte I Prática (Dr. Aristóteles Goes Neto e Dra. Aline Vaz).
10:00 - 10:20
Coffee-Break.
10:20 - 12:20
Estudos metagenômicos e modelos probabilísticos aplicados para a descoberta de novos virus – Parte II - Prática. (Dr. Arthur Gruber)
12:20 - 14:00
Almoço.
14:00 - 16:00
Análises de dados metagenômicos no “Rstudio” Parte II - Prática. Dr. Aristóteles Goes Neto e Dra. Aline Vaz)
16:00 - 16:20
Coffee-Break.
16:20 - 17:20
Tempo para realização do projeto, com acompanhamento do professores - Prática.
Dia 10 – Sexta-feira - 17 de agosto
8:00 - 10:00
Apresentação de trabalhos, com acompanhamento dos professores - Prática.
10:00 - 10:20
Coffee-Break.
10:20 - 12:20
Apresentação de trabalhos, com acompanhamento dos professores - Prática.
12:20 - 14:00
Almoço.
14:00 - 16:00
Apresentação de trabalhos, com acompanhamento dos professores - Prática.
16:00 - 16:20
Coffer-Break.
16:20 - 17:20
Encerramento do curso (Dr. Vasco Azevedo e Dr. Luiz Alcantara).